N-HEKSAN, %98 veya daha yüksek saflıkta, sıvı kromatografi uygulamaları için tercih edilen bir çözücüdür. Özellikle analitik kimya laboratuvarlarında, çeşitli organik bileşenlerin ayırma ve saflaştırma işlemlerinde kullanılır. Çalışma prensibi, sıvı kromatografi cihazlarındaki aktif maddelerin uygun bir yüzeyde ayrılması ve analiz edilmesidir. Sıvı kromatografi ortamında mükemmel bir mobil faz olarak görev yapar, bu sayede hedef bileşenler arasında yüksek çözünürlük elde edilir. N-hekzan, düşük viskoziteye ve iyi akış özelliklerine sahip olmasından dolayı laboratuvarlarda yaygın olarak tercih edilmektedir. Ancak, flammable (yanıcı) olduğu için, çalışma sırasında gerekli güvenlik önlemlerinin alınması büyük önem taşımaktadır.